Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 酪氨酸调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合肽键和脱氧核糖蛋白质 DNA 组成的特殊蛋白质本体，在原核和真核生物的线粒体组之中分布广泛且普遍存在。R-loop 在很多关键的病理学全过程之中发挥作用极为重要必需功能，包括染色质去除、磷酸化磷酸化、DNA 损伤修复以及线粒体组有利于性等，但其如何被精确磷酸化的功能亦然不吻合。m6A 去除作为信使 RNA 上丰度最高的去除类型，广泛加入哺乳动物的成年期、免疫系统、造血更新、脂肪分化、以及填充和转移等生命全过程。然而，现阶段亦然不吻合 m6A 是否能作为 R -loop 之中 RNA 小分子的本源特征来磷酸化 R -loop 水准，进而发挥作用各种病理学必需功能。之中科院北京线粒体组研究工作所杨运桂、任捷与上海交通大学生科院孙前文设计团队密切合作研究工作，挖掘出 m6A 能有利于 R-loop 的形成，进而磷酸化线粒体磷酸化的适当暂时中止。这一成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日的网站发表于《细胞研究工作》（Cell Research）周报。研究工作设计团队首先通过白斑分子混种和免疫系统荧光新科技，挖掘出敲低 m6A 的大基转移酶 METTL3 显着降低 R -loop 水准，且该磷酸化作用发挥作用 METTL3 的大基转移酶活性。随后，设计团队新成员能用高效液相色谱合组质谱新科技，挖掘出相对来说于染色体联结的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 小分子有愈发富集的 m6A 去除。全面性能用基于脱氧核糖蛋白质 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合肽键免疫系统共沉淀高通量化学合成新科技（ssDRIP-seq），挖掘出下调的 R -loop 主要富集在磷酸化暂时中止区域内，R-loop 波动程度与 m6A 的距离和去除水准相关。为了揭示 m6A 对 R -loop 磷酸化的病理学必需功能，研究工作设计团队绘制了 RNA 聚合酶磷酸化基因座的高分辨率图说，并在 MYC、ACTIN 线粒体上同步进行多种磷酸化活性检测，挖掘出 m6A 有助于 R -loop 形成是磷酸化暂时中止下一阶段的都是在，可以防止 RNA 聚合酶的磷酸化通读。就此，设计团队新成员实现了针对磷酸化通读的报告线粒体控制系统，通过 m6A 去除基因座的突变全面性证实 m6A 对于 R -loop 形成及磷酸化暂时中止的关键作用。该研究工作挖掘出了 m6A 的大基化去除的共磷酸化磷酸化必需功能，揭示了 RNA 的大基化去除对染色质本体的影响，以及 R-loop 本体之中的 RNA 小分子被去除后对其自身一个系统的磷酸化功能，阐释了 m6A 通过有利于 R-loop 而有助于磷酸化正常人暂时中止的现像，为全面性研究工作 m6A 与 R-loop 的磷酸化功能和具体来说病理学必需功能提供了必需的新科技和理论之上。该研究工作得到了之浙江大学关键性先导科技专项、国家自然科学以及国家重点研发计划等私人机构赞助。零碎出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).