Nature：新冠病毒在体内与人体抗体进行博弈，病毒不断性状，抗体也不断进化

在世界上，相当严重急特质呼吸道综合症冠锥形HIV早就细菌感染了的大过9880上千人，造成的大过210上千人死亡，此外，在英国、南非等邻近地一区也陆续辨认借助于了新近冠HIV的甲基化菌株。随之而来岌岌可危的疫情，各国陆续开发了和批准使用了各种针对新近冠HIV的疫苗。

那时候，剑桥大学Rindra K. Gupta课题组在顶级Journal《自然》上刊发了一篇极其重要的数据分析论文[1]，首次展现了新近冠HIV在免疫力较低下病症体液相异的过程。他们在数据分析一名因破碎一区B亚基乳腺癌而免疫力较低下的慢特质新近冠HIV细菌感染者时辨认借助于，动手术期血清病人须要带来极端的选择压力，导致对抗HIV体特异特质降较低的相异毒株视作主要毒株[1]。

其之中尤其在在的是，数据分析医务人员辨认借助于了一个非常神奇的灵长类周期特质：新近冠HIV在灵长类借助于一个降较低抗HIV体之中和作用，但须要导致细菌感染潜能减少的甲基化的同时，竟然还须要借助于现一个细菌感染潜能较野生型HIV提升2倍的甲基化[1]。

用一个提高细菌感染潜能的新近甲基化，补偿另一个降较低抗HIV体特异特质甲基化带来的毒特质损失。新近冠在体液的灵长类真是断了！化学家首次阐明新近冠在免疫力较低病症体液灵长类过程，代偿系统让其逃避抗HIV体，保持毒力

关于英国品系和南非品系的来源，之前就有化学家猜测：在免疫较低下病症的慢特质细菌感染期两者之间，长年的病人给HIV发放了灵长类的良机。不过，还没有数据分析医务人员在病症体液通过观察到整个过程。

Gupta和他的开发团队之所以能记录下新近冠HIV适应特质灵长类的全过程，是因为一个类似的病例。这名病症是一名70多岁的成年人，他因鼻咽拭子监测结果阳特质开刀。与普通病症不同的是，这名病症在2012年被治疗为破碎一区B亚基乳腺癌。

在哮喘本身和化疗的双重作用下，这位新近冠HIV细菌感染者观感借助于B亚基和T亚基同德合水痘。一般来说他的免疫力非常较低。

这名病症在出院后的第41天和54天分别放弃了两个疗程的威尔森西韦病人，在第63天和65天放弃动手术期血清的病人，在第93天放弃了一个疗程的威尔森西韦和动手术期血清的病人。

▲病人期内病人方式也与HIV分布一区结构设计的变化之两者之间的关系

转化上图，我们不难看借助于，在一开始ORF7a之中的T39I（C27509T）甲基化占去比最高，在第45天达到79%。在第66天，NSP2之中的I513T（T2343C）甲基化和RdRp之中的V157L（G13936T）甲基化从第54天的几乎监测不借助于来，飙升到几乎占去比100%。

尽管如此，数据分析医务人员还是察觉到威尔森西韦的病人没有变动HIV分布一区的结构设计。当病症放弃动手术期血清病人之后，情况就变了。

Gupta和他的同事通过观察到新近冠HIV的分布一区结构设计时有发生了剧烈的变化。新近冠HIV刺突亚基S2之中比如说D796H甲基化和S1 N端亦然之中比如说ΔH69/ΔV70缺失甲基化的品系，在第82天视作主导分布一区。到第86和89天，刺突亚基Y200H甲基化和T240I甲基化，以及NSP2之中的I513T甲基化，RdRp之中的V157L甲基化，NSP15之中的N177S甲基化占去优势主导地位。D796H甲基化和ΔH69/ΔV70则降至10%或更较低的频率。

到第93天新近冠HIV刺突亚基P330S甲基化和S1 NTD之中的W64G甲基化丰度接近100%，而D796H与ΔH69/ΔV70丰度

他们辨认借助于，另行的ΔH69/ΔV70甲基化让HIV的细菌感染潜能比野生型提高了2倍，另行的D796H甲基化须要导致新近冠HIV的细菌感染潜能明显减少；但是D796H和ΔH69/ΔV70同时存在的话，新近冠HIV的细菌感染潜能就保持定值。

然而，消化道也不是吃素的，消化道也须要随着HIV甲基化，大大变动自己，形成新近的抗HIV体对抗HIV甲基化。

近日，来自美国洛克菲勒大学和西奈山伊坎医学院的数据分析开发团队在《Nature》上刊发了题为Evolution of antibody immunity to SARS-CoV-2的数据分析成果，辨认借助于病症在细菌感染SARS-CoV-2后6.2个年初两者之间，虽然体液之中之中和活特质抗HIV体明显降较低，但记忆B亚基在大大灵长类消除体亚基的大甲基化，表达借助于了不具备提高投效和对RBD甲基化的抵抗HIV力的抗HIV体，体液免疫始终在其发展。

为了数据分析细菌感染SARS-CoV-2的病症体液的长年抗HIV体免疫潜能，数据分析医务人员对87名COVID-19病症在细菌感染后1.3和6.2个年初时体液之中的之中和抗HIV体高水平及记忆B亚基特征进行了数据分析。

蛋白质同德免疫吸附（ELISA）和自动血清学测定结果辨认借助于，1.3到6.2个年初两者之间，体液之中的抗HIVRBD（新近冠HIV刺突亚基介导转化亦然）和抗HIVN（核糖核酸）抗HIV体均明显减少，且各抗HIV体的减少略为均与初始抗HIV体高水平比为。使用内含SARS-CoV-2刺突亚基的HIV-1假HIV精确测量血清之中和活特质，辨认借助于与1.3个年初时相比之下，6.2个年初时针对新近冠HIV的之中和抗HIV体滴度减少了5倍，这表明SARS-CoV-2细菌感染后6个年初时，病症体液不具备之中和活特质的的抗HIV体明显降较低，但仍可监测到。

抗HIVSARS-CoV-2的血清抗HIV体动力学

记忆B亚基是由免疫系统之中的B亚基并存而来的，对抗HIV原不具备特异特质的识别潜能，当抗HIV原二次细菌感染机体时，记忆亚基可直接增殖、并存消除浆亚基，并消除抗HIV体，与抗HIV原转化。对病症体液的SARS-CoV-2记忆B亚基数据分析，辨认借助于1.3到6.2个年初两者之间，记忆B亚基群体之中表达抗HIVRBD的IgG抗HIV体的记忆B亚基占去比观感借助于小幅但明显的减少。

抗HIVSARS-CoV-2 RBD的抗HIV体核酸

此外，数据分析医务人员还辨认借助于，1.3和6.2个年初时的记忆B亚基还观感借助于了HIV一般而言的的更换和抗HIV体核酸的演变，这也明确指借助于在受到细菌感染后1.3到6.2个年初两者之间，免疫系统始终在过后优化对新近冠HIV的抗HIV体免疫反应须要。对这两个时两者之间点之中的122个代表特质抗HIV体对RBD的反应须要特质进行评估，辨认借助于其之中有115种能与RBD转化，且6.2个年初时抗HIV体的EC50（半最大效应浓度）明显提高。

抗HIVSARS-CoV-2 RBDHIV反应须要特质

那么这些抗HIV体对HIV甲基化菌株的选择特质如何呢？数据分析医务人员对其与SARS-CoV-2的野生型RBD和甲基化体RBD的转化效果进行测定，辨认借助于两个时两者之间点均借助于现的抗HIV体克隆之中，有83％的抗HIV体克隆在6.2个年初时与甲基化RBD的整体而言转化减少，且在E484(委内瑞拉及南非甲基化株甲基化所在位置)，Q493，N439，N440和R346这些RBD甲基化所在位置上是转化减少最为明显。对能与甲基化RBD转化的抗HIV体的之中和丰富性进行数据分析，辨认借助于除了不具备更强的之中和力外，灵长类的记忆B亚基表达的抗HIV体也不具备很高的之中和丰富性，部分抗HIV体能之中和一种以上HIV见下文。

抗HIVSARS-CoV-2 RBDHIV的之中和活特质

终于，数据分析医务人员数据分析，抗HIV体的大大灵长类有可能是通过抗HIV原以免疫复合物的方式也保留在滤泡棒状锥形亚基很薄很长时两者之间，使得在生发之中心地带进行的B亚基消除体亚基的大甲基化和大大选择而时有发生的，消化道组织之中残留的较低高水平HIV亚基质也有可能作为抗HIV原进一步促使抗HIV体大大灵长类。

原始借助于处：

Kemp SA, Collier DA, Datir RP, Ferreira IATM, Gayed S, Jahun A, Hosmillo M, Rees-Spear C, Mlcochova P, Lumb IU, Roberts DJ, Chandra A, Temperton N; CITIID-NIHR BioResource COVID-19 Collaboration; COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, Sharrocks K, Blane E, Modis Y, Leigh K, Briggs J, van Gils M, Smith KGC, Bradley JR, Smith C, Doffinger R, Ceron-Gutierrez L, Barcenas-Morales G, Pollock DD, Goldstein RA, Smielewska A, Skittrall JP, Gouliouris T, Goodfellow IG, Gkrania-Klotsas E, Illingworth CJR, McCoy LE, Gupta RK. SARS-CoV-2 evolution during treatment of chronic infection.Nature. 2021 Feb 5. doi: 10.1038/s41586-021-03291-y

Gaebler C, et al. Evolution of antibody immunity to SARS-CoV-2.Nature. 2021. PMID: 33461210